长期不理朝政的明神宗
明朝自从嘉靖后期以后，政治日益腐败。明穆宗到神宗时期，虽然有张居正等大臣推行财政和军事改革，一定程度上改变了明朝的颓势，但是终究是昙花一现。很快明神宗又开始长期怠政。万历十四年（1586年）十一月，明神宗开始沉湎于酒色之中，同时，为争立皇太子，演成了旷日持久的“国本之争”，门户之争日盛一日，互相倾轧。东林党、宣党、昆党、齐党、浙党，名目众多。
因立太子之事与内阁争执长达十余年，最后索性三十年不出宫门、不理朝政、不郊、不庙、不朝、不见、不批、不讲。万历十七年（1589年），明神宗朱翊钧不再接见朝臣，内阁出现了“人滞于官”和“曹署多空”的现象。至于贪财一事，朱翊钧他在亲政以后，查抄了冯保、张居正的家产，就让太监张诚全部搬入宫中，归自己支配。为了掠夺钱财，他派出宦官担任矿监税使，四处搜括民财。
万历二十年至二十八年（1592年—1600年）间，明神宗针对边疆的问题，发动了万历三大征，耗费了大量帑银。万历二十年（1592年），哱拜和哱承恩父子在宁夏银川反叛，明神宗派李成梁的儿子李如松为总兵，率军平叛，一举平息了哱拜之乱。[9]从万历二十年（1592年）到二十七年（1599年），日本关白丰臣秀吉发动侵略朝鲜的战争，朝鲜王京陷落，八道失陷七道。[10]朝鲜王朝请求明朝援助，明神宗决定派兵到朝鲜，援朝抗倭。这场战争时断时续，前后进行了七年多。最后，日本因丰臣秀吉去世，将侵朝日军撤出朝鲜。万历十七年（1589年），播州（播州就是今贵州遵义地区）宣慰司使杨应龙发动叛乱，明神宗朱翊钧派兵平叛。这场战争时断时续，一直到万历二十八年（1600年），最后的结局是明军八路进兵，四月告捷，平息了杨应龙之乱。[11]这三场战争也严重消耗了明朝的财力。
其三·大明年辽东防务吃紧
明朝统一中国后，在东北设官置治，建卫设防。万历时从鸭绿江至嘉峪关设置“九边”即九个重镇，其中辽东辖今辽宁大部地区。明朝对女真各部的统治，一面以羁糜政策笼络其首领，封官晋爵赏赐财物；一面分化女真各部，使其互相对立，以便分而治之。
在明与后金对抗中，居于开原附近的女真族叶赫部，为避免被努尔哈赤吞并，依附明朝，反对后金。鸭绿江以东的朝鲜李氏王朝，也倾向于明朝。蒙古察哈尔部，住在归化城（今内蒙古呼和浩特）与承德之间，与后金对立
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