黎元洪当过湖北军政|府都督，自己也觉得窝囊，人家也笑话他是“床下都督”，讽刺他在武昌起义时以清廷湖北都督身份被起义人员从床下抓出来。但是他反应挺快，在群龙无首时摇身一变，又成为起义后掌握湖北大权的“首义都督”了。这个事既是他的耻辱，又是他的资历。
那么他真当上中华民国大总统了，他也想有所作为。想干吗呢？按照皿煮法制政体建设中华民国。他主张扩大国会权限，以抵制段祺瑞的专断独行。
段祺瑞则指挥麾下的研究系反对省制入宪，主张缩小国会权利，改两院为一院，以迎合皖系军阀专制的私利。
双方在国会制宪等问题上的分歧日益严重，导致两人很快就在政见下较量了起来。因一方为总统府，一方为国务院，所以它们间的争斗被称为“府院之争”。
第一件事，黎元洪当总统之后，南方护国军说，袁世凯为什么复辟呢？手下有“十三太保”支持他复辟，得严惩这“十三太保”。
黎元洪刚要下手惩戒这“十三太保”，没想到国务院来求情了：这段芝贵您给免了吧；李鸿章他侄子也来求情：您把严复跟刘师培给免了吧；国民党那边也来求情：免我们这边的两人吧，他俩不是真的支持复辟，那都是安排的卧底…
唯一和其他人抱不成团的关外张作霖也被张汉卿一番表演成功地“洗白”，以及各方政治派系都来求情，最后不能惩罚包括杨度在内的这些人，等于这事就不了了之了。黎元洪这才认识到，想跟当时各种复杂的政治派系打交道太难了，他手里没兵权，所以没有实权。
实权在谁手里呢？在国务院总理段祺瑞手里。段祺瑞把黎元洪请出来就是让他当傀儡的，黎元洪不甘心当傀儡，你想想两人能不闹矛盾吗？所以闹出很多有趣的事来。
先是在国务院秘书长人选问题上，黎元洪和段祺瑞发生了争执，因为段祺瑞力主要选徐树铮担任。
按理说，国务院秘书长和总理交集最大，所以段祺瑞即使选择亲信徐树铮也没什么。但是徐树铮是个恃才傲物的人物，他奔走于府院之间，处处越俎代庖，以前就为袁世凯所厌恶。不过不管黎元洪怎么不满，徐树铮多么跋扈，段祺瑞就是喜欢并始终信任他，这也是民国官场的异数。
被逼着继总统的黎元洪听说仍任徐树铮为国务院秘书长，马上就表示：“我怕这个人，总统可以不干，但绝不与人共事！”他让带话的总统府秘书长张国淦说：“请你告诉总理，一万件事我都依他，只有这一件事办不到
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