虽然家境富裕，但倪瓒未染上纨绔子弟习的不良气，对自身的学习修养，抓得挺紧。家中藏书众多，经、史、子、集、佛法、道经、名家的书、画都有。倪瓒每日在家精心研读典籍外，还要练习书法、临摹古画。有时外出游览，见到有价值的景、物都随手描绘，一方面精细地观察大自然，另一方面继承传统技法，博采各家之长，为他后来在绘画上的创新打下了坚实的基础。
倪云林有严重的洁癖。他让仆人去十几里之外的惠山上挑泉水，仆人挑水回来，发现倪云林都在家里等着，而且只用挑在前面那桶水泡茶，身后那桶水用来洗脚。有时候天阴下雨、道路泥泞，上山挑水又走那么远的路实在不容易，为了泡茶可以理解，家里井水就能洗脚，仆人理解不了，难道是老板故意整我？忍不住问原因，倪瓒的解释很简单，怕仆人在路上放屁，身后的那一桶只能用来洗脚。仆人听了心里有气又笑，这么远的路，谁能保证前后两桶水没有调换过位置？再说了那屁能不能熏到水里也有待研究。这大概是人们常说的“眼不见为净”吧！
平时生活中，餐具、衣服、家具、地板一尘不染，倪云林的文房四宝也有两个专用仆人负责管理，随时擦洗。连院里的梧桐树，也要专人每天早晚用水冲洗干净。
一天，朋友来访，酒宴之后太晚，就住下了。他怕朋友不讲卫生，别睡到半夜出了门就在院里尿啊！一夜之间，他起来三四次，看这朋友喝醉了还知道进厕所，终于可以放心睡了。
倪瓒刚躺下，忽然听见朋友咳嗽一声，又担心得一宿未眠。天亮后朋友也走了，他急忙让仆人寻找朋友吐的痰在哪里。仆人找遍每个角落也没见痰的痕迹，老板什么脾气仆人知道啊！怕挨骂，只好找了一片落在地上的梧桐叶，自己吐上一口。跑到老板面前报告，找到啦！倪瓒撇着嘴瞄了一眼，便恶心的捂住鼻子，往一旁躲开，命令仆人送出三里之外再扔掉。
倪云林不是假干净，他有自己的专用厕所。在地上打木桩，在木桩上用香木搭建地板和围屏，再用香草制作屋顶，香木地板上留有排便的小窟窿，地面上挖土坑，坑里填满雪白的鹅毛。他在香厕里方便，排泄物落在坑中，立即被轻盈的鹅毛盖住，闻不到也看不见，比现在熏着线香的水冲式厕所还先进，看来，贫穷真的限制了我们的想象！
因为洁癖，倪瓒很少近女色，跟老婆在一起也特别注意卫生。但有一次，他看中了一名歌姬，人漂亮，琴棋书画诗酒花茶聊得开心，倪瓒前思后想，把歌姬带回家过夜。歌姬先洗澡，在仆
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