蔡元培的祖父经营典当业，是当地一家典当铺的经理。因行事公正，又善经营，遂致家业渐渐兴旺。其祖父生七子，蔡元培的父亲为长子；“三子好武，不知往终；居家六子，次子为绸缎庄经理，长、五、七子分别为钱庄经理，四子亦经营钱庄，只有六子读书”。
蔡元培有兄弟四人，姊妹三人，他是家里的老二。说来奇怪，他们兄弟姊妹，排行占单数的，长得像母亲，面椭圆、肤白皙；排行占双数的，却像父亲，方脸、肤黄。蔡元培排行老二，长得就像父亲的翻版。蔡元培的七个同胞兄妹中，后来有四个夭折，只有他和大哥、三弟活了下来，三人分别相差两岁。
长到6岁时，家境不错的蔡元培，就开始在自家延请教书先生开设的私塾中读书。
古代教育主流是儒家教育，儒家把教育分为这样几个阶段：
0岁到3岁，为“家学”时期，主要的任务是健康成长，还有基本生活常识和礼仪规范。
4岁到6岁，为蒙学时期。蒙学的主要任务有礼教和乐教两部分。
7岁到12岁，为学馆时期，主要任务是读经，也有习字、练武等活动。6岁以前一般不读经。读经要“详训诂、明句读”，是要详细解释的。
13岁到20岁，为官学时期，一般会去县学、府学继续学习，学习的内容主要是解经，也包括琴棋书画、诗词文赋、经史子集等内容。
而后21岁到35岁，这个时期学习的主要任务有两个：一个是学习专业，如天文地理、农业水利、医卜数术、政治军事；还有一个任务，是行万里路、交游。这是古代教育里一个非常重要的环节和阶段，也有为出仕做官做准备的。
36岁到70岁，则是古代读书人出仕做官时期。
清代地方的官学有名无实，青少年真正读书受教育的场所，除社学和义学外，一般都在地方上或经济宽裕人家所办的学塾里。
蔡元培进入私塾之后，私塾老师周先生教他读《百家姓》《千字文》《神童诗》，读书之外还要练习写字和对对子。稍长一些，就开始读最基本的儒学经典，像“四书”(《大学》《中庸》《论语》《孟子》)，“五经”(《诗经》《书经》《周易》《小戴礼记》《春秋左氏传》)，并学习写作八股文。
在私塾课堂上，体罚教育绝对是合理合法的。所谓“教不严，师之惰”“不打不成材”，调皮的孩子们在学塾里，被戒尺打手心是再正常不过的事。那个年代的家长，是绝对不会因为
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