正当黎元洪以为大局总算得以维持之时，没料到风云突变。
二十九日，蚌埠方面倪嗣冲首先宣布独立。随后河南、浙江、山东、山西、福建、陕西、奉天等省纷纷响应，也先后宣布独立。
这次北洋各省宣布独立，和以前南方各省宣布独立的性质完全不同。以前是南方各省反对北京政.府，这次是北洋军人反对北京政.府。以前的北京政.府是掌握在北洋军阀大头子的手里，而此时的北京政.府只有一个赤手空拳的总统，坐困公府，毫无抵抗力量。
北方各省一宣布独立，已经满口答应组阁的李经羲，躲在天津租界不敢出来了。
黎元洪迫切希望李到北京来就职，派公府秘书长夏寿康、军事顾问金永炎到天津专程迎接，又派直系军人江西督军李纯前往劝驾。
黎元洪竟然把李当作是解救时局危机的唯一救星，以为只要他肯到北京来就职，就可以取得张勋的实力援助，制止独立各省进兵北京。可是这个久已想做国务总理的李经羲，当国务总理已经到手的时候，却又没有做国务总理的勇气。一会儿说要往北戴河避暑，一会儿又说愿意让位于王士珍，就是坚决不肯来京。
黎元洪一直把段祺瑞当做自己的对头。其实，他或许不知道，段更是他的依靠和保护神；是连结主导当时政局的最大势力——北洋派的纽带和桥梁。所谓对立统一体，失去了对立也就失去了统一。
有段在，北洋派虽然已四分五裂，但在大面上，还是能够聚集在段的旗帜下的。搞掉了段祺瑞这个对头，黎元洪也就失去了段这个保护神，马上成为北洋派的众矢之的。
督军团大闹北京城时，在黎元洪看来，唯独张勋置身事外。他觉得，北洋诸将中唯有张勋能够抗衡段祺瑞，只能把希望寄托在张勋身上，指望张出面收拾残局。
当黎元洪陷入孤家寡人境地时，下野在天津的段祺瑞却门庭若市，研究系、交通系以及亲日派纷纷奔走其门。
梁启超为首领地研究系，完全倒向段的方面，大批研究系国会议员纷纷辞职离京。汤化龙也辞去了众议院议长，以拆国会的台。
段祺瑞也没闲着，此刻正在天津准备组织临时政.府。先推举徐世昌为陆海军大元帅，一旦独立各省会师北京把黎元洪赶下台，即召集临时国会推举徐为临时大总统。
关于组织临时政.府的之事，段已通电征求过北方各省的意见。临时政.府阁员名单也已备好，包括研究系、交通系和亲日派各方面人物。
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