巨大。好在是在暴乱发生前，日本在各使馆布置了大量的警力，总算是没有让暴徒攻破各使馆，也算是不幸中的万幸。
暴乱虽然被平息下去，但后续的清算工作足足持序了近1个月，仅抓捕的人员就达4万5千余人，几乎是只要参与了暴行的人都被抓捕。主犯被确认17人，主从犯确认41人、次从犯多达500余人。
明治天皇对这次暴乱相当的行为是相当的恼火，因此对他们的处罚极为严厉，主犯、主从犯均被处以死刑，次从犯被判罚无期，发配到北海道服役终身，其余参与人员最少的也被判罚10年的刑期。
而在新首相的确立方面，寺内政毅身受重伤，一时半会好不了，而且这次暴乱中有共计417名陆军士兵参与，也让陆军系十分尴尬，显然再由陆军系出任首相，也是难以服众的。最后众人协商决定，由西园寺公望出任首相，重新组阁。
西园寺公望是明治维新的元老之一，也是政友会的组建者之一，无论是个人威信，还是资历，都是目前日本出任首相的最佳人选，也是各方势力都能认同的人选。