把责任全都推卸到了部将身上，将闽安侯周端削职夺爵，永不叙用。总督林察、统领王秀奇、苏茂及以下诸将，皆降级留用。
旋即，郑成功再次致书定国，对失期之事作出了解释，并希望能够继续与定国保持联络。
书信曰：“西宁王殿下惠鉴：客岁籧使遥来，同仇同袍之订，甚符夙心。用是敿干救胄，大集楼船，方刻程期，而敝员李景复以台命至，展读再四，知殿下内急君父之忧，外切仇仇之痛，不佞恨不能征帆倏忽，直扫珠江，同挈故土，以迎乘舆。讵意船师未到，而大师先已班回数日，有贵部官兵自粤来投者，细讯其故，盖以骄兵致挫。胜负兵家之常，不足深忧，但敝船逗遛，既不能先期会师，又不能奋图后援，使丑虏长驱，实与有罪焉。已将水陆各将审定功罪，乃知依违不前者，闽安侯周瑞，已重行捆责，革职闲住，乃念其有功，不然已正法矣。尚有贵水师汪都督孙泊大鹏，甚非久计，不佞现遣将员，令其乘董抵鹭，待殿下捷音重至，向我舟师齐发，甚为两便。尔时腥气，在在而然，所恃血性男子，坚乃心肠。不佞于客冬十二月，一鼓而下漳、泉、兴各郡邑，虏束手莫措，竟无敢逆我颜行者。兹已萃夺满汉，悉其精锐，倾国而来；复移援粤两酋之师，以天下全力而来攻我土地，不佞秣马厉兵，静以破之，绰绰有余。此一战也，虏力既挫，必一败而不可收，不惟江南半壁，在吾目中，即天下大势，亦约略可审，此不佞所可自信者。今援广之精锐，已悉来闽，则粤东势必空虚，乘机袭取，正其时也。殿下幸迅师入粤，或取羊城，或取高、雷、廉，定有摧枯拉朽之势，从此长驱破竹，共抵金陵，聚首策勋，顾所愿也。”
郑成功在信中委婉地指出定国此番失利的原因主要是由于骄傲轻敌所致，而自己对会师误期也负有一定的次要责任，并已对相关人员作出了军法处置。同时劝慰定国，胜败乃是兵家常事，不要太过悲观，若下次再度进攻广东， 他必然亲率大军前来会师，共同北伐，恢复大明江山。
只不过郑成功对当前形式的估计还是过于乐观了，自从新会失利后，定国所部损失惨重，元气大伤，已然失去了主动向清军进攻的实力。此外，随着孙可望野心愈发膨胀，定国此时必须在永历帝和孙可望之间作出抉择，大举反攻两广的时机已经不复存在了。