森二世与教会在意大利的领地受到了支持对立教宗aus ii的罗杰二世的威胁，所以他也加入了约翰与洛泰尔的联盟。然而事实上该同盟难以抗衡罗杰二世，罗杰于1139年通过米尼亚诺条约从教皇处获得了君位。洛泰尔三世的继任者康拉德三世寻求约翰最小的儿子曼努埃尔能与德国皇室联姻。最终，康拉德的小姨子bertha of sulzbach出嫁到了拜占庭。与此同时，罗杰二世也希望能与约翰二世的儿子联姻，但他却没能成功。
约翰二世倾向于干涉妻子的娘家匈牙利王室，拜占庭帝国把在君士坦丁堡接待流亡的匈牙利王位竞争者视为扩大帝国影响力的方法和有用的安全策略。然而，匈牙利人却将这种干涉视为战争的挑衅。匈牙利与塞尔维亚的联盟给拜占庭在巴尔干西部的领土造成了严重的威胁。
约翰对东线的外交政策与他的父亲相似--即挑起科尼亚苏丹与控制安纳托利亚内陆东北部的达尼什曼德王朝之间的矛盾。塞尔柱苏丹masud还提供军队支援约翰进攻达尼什曼德王朝的城市kastamuni，但是和塞尔柱人的联盟被证明是不可靠的，塞尔柱军队放弃了这次出征，趁夜拔营而去。
在黎凡特的十字军国家普遍承认拜占庭对于安条克的主张是具有法律效果的，但实际上只有当拜占庭皇帝以武力威胁他们的时候他们才会承认。约翰二世在黎凡特的外交最高峰是1137年他接受了安条克亲王埃德萨伯爵的黎波里伯爵的效忠。拜占庭帝国渴望被认为拥有全部十字军国家的宗主权，其野心在在约翰在通告耶路撒冷王国国王福尔克他将去耶路撒冷武装朝圣时便可见一斑。
宗教事务
持续不断的战争几乎占据了约翰二世的大部分统治时间，而且他不像他的父亲一样热衷于参与神学研究和教义辩论，他看起来满足于把宗教事务交给宗主教(牧首)和教会阶层去处理。只有当宗教直接影响到了帝国政治，例如有关教宗或希腊拉丁教会联合的时候约翰才会参与其中。他还组织了许多希腊与拉丁教会间的神学辩论。
约翰和他的妻子共同参与了宗教与慈善事业，并以他们接手筹建的许多教会建筑而闻名，其中包括著名的君士坦丁堡潘托克拉托尔基督修道院(意译为全能者基督修道院，现为泽伊雷克清真寺，约翰二世的皇后在此兴建了基督全能者修道院(tokrator)，包括基督全能者教堂、图书馆和医院。皇后去世后，皇帝在第一座教堂之北又修建了仁慈堂(theotokos eleousa)，对外
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