长州藩通过中国领事的居中调停，他们成功派出代表跟幕府开始谈判。
但谈判很不顺利，幕府现在形势占优，他们很想将战争进行下去，借助中国的力量，彻底消灭这些割据了多年的强藩势力。
幕府不但在领地问题上寸步不让，别说长州藩提出的，丹波、摄津等国了，他们连长州藩占有目前的十四国都不同意，只同意长州藩退回长门、周防两国，保持原本的势力，也不同意废除参觐交代制度。
见到这种情况，反倒让西南强藩团结了起来，他们团结，不是想为长州藩争取利益，他们是为了自保，如果长州藩退回了长门、周防，他们吞下的那些领地也得吐出来，而且还要担心幕府秋后算账。所以他们在结束参觐交代，得到直接觐见天皇权力的态度上，跟长州藩是一致的。
长州藩人才济济，外交人才也不缺，他们连横合纵，很快就跟趁火打劫的东北强藩达成了共同行动的盟约，东北强藩也派人来谈判，并且提出了一致的要求，结束参觐交代，大名可以自行觐见天皇。
幕府的压力顿时大了起来，而且中国领事不是一味支持他们，中国领事希望幕府能接受对方一些条件，然后让日本恢复和平。并且表示，虽然中国议会同意出兵十万，但十万軍队能否解决幕府的困境，并不能保证。一旦十万中国軍队都无法阻挡强藩联军的话，中国不可能提供新的支持。长州藩在压力之下，将自己的直属軍队已经扩大到了十万人，萨摩、熊本等西南强藩开始踊跃出兵，强藩联军的规模不断扩大，已经高达十五万人。东北强藩也开始直接出兵，在跟幕府接壤地区威慑，东北强藩人力缺乏，但兵员素质更好，他们的兵力也高达五万人，强藩的軍队总数高达二十万。幕府兵力虽多，可大多数不堪使用，如果不能进行彻底的改革，能战的就只有中国的十万援军。
领事告诉幕府，中国軍队毕竟是劳师远征，战斗力能保留多少尚未可知，一旦战败，则强藩不再畏惧中国，不管中国朝廷能否说服议会继续增兵，恐怕在新的援兵到来前，强藩就能完全攻占幕府领地。
领事还告诉幕府，他们缺的只是时间，只要时间足够，他们下决心重新打造軍队，中国提供一些支持，帮忙训练士兵，派遣军事顾问，甚至帮助幕府培养军官，很快幕府軍队就能压倒强藩，到时候幕府大可以反攻回去。
加上此时幕府境内局势十分不稳，大小诸侯心怀异志，农民、市民不断一揆，财政濒临崩溃，全靠借债度日，再不结束战争，幕府统治也得崩溃。
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