接着轩辕独自率领百万亲兵，杀入乱军之中，来捉叛军的首领们。
他要抓住这些乱臣贼子，将他们送到陈都，在诸侯面前将他们一一斩首，以此震慑他们。
叛军首领见势不妙，正准备溜走，然后混乱的士兵四处冲击，将他们冲散，然后被轩辕带着人给包围拿下了。
除了被杀和逃跑的，其余的叛军均被俘虏，然后被押解送到陈都进行经济建设。
轩辕班师回朝，这次围剿叛军，将天下诸侯给一举震慑住了。
首领们纷纷表示臣服，坚决执行中央命令。
三日后，万余叛军首领在刑场被公开处决，最前面的观众就是被轩辕召集而来的首领们。
随着上万颗头颅落地，刑场噤若寒蝉，首领们纷纷沉默，思考着反抗中央命令的代价，最后得出一个结论：小命要紧！
轩辕终于整合了除了南方部落之外的所有人族部落。
之后他一边命令靠近九黎部落的人族部落积极抵抗，一边让各部落首领回自己的部落，操练兵马，准备倾全族之兵，与蚩尤率领的九黎部落一战！
蚩尤这边也并没有停止征战的脚步，他将投降的南方部落军队整合，挑选其中的精锐，最后得到了千亿附庸军队，开始向北进攻，直指人族的政治经济文化中心——陈都。