御坂妹妹其实并不是御坂美琴的亲妹妹，但是论血缘相似度的话，却更加超过亲妹妹。
因为，这些御坂妹妹们，其实就是使用御坂美琴的DNA做出来的克隆人，是学园都市中一项《能力者量产计划》的产物。
总数已经超过了两万名，她们没有名字，只有编号，从00001到20000，还有几位编外序列。
学园都市当中有一则怪异传说，说是在入夜之后，会在人迹罕至的街道上看到复数以上的克隆人，说的就是御坂妹妹。
原本这些御坂妹妹们是被当做量产型能力者，准备培养成军队的。
但是，却因为身为克隆人的御坂妹妹们自身身体存在缺陷，电气能力只能被称之为[缺陷电气]，连本体御坂美琴百分之一的程度都达不到，故失去研究价值，《能力者量产计划》被永久冻结。
然而...
事情远没有就此结束。
虽然《能力者量产计划》被冻结，但是另一个！《绝对能力者进化实验》项目却在之后成立！
这个计划的目的，是为了让学园都市内的最强者，排名第一名的超能力者一方通行，进化到LV6，也就是神之领域。
以凡人之躯，触及神之领域。
学园都市制造的超级计算机[树状图设计者]曾经计算过一段数据，为了让一方通行进化成绝对能力者，[树状图设计者]得到的结果是！
只要在128种不同的战场将超电磁炮（御坂美琴）击杀128次，一方通行便能够进化成超能力者。
但是，御坂美琴只有一名，无法完成被击杀128次的构思，于是[树状图设计者]再次计算，最后得出，使用御坂美琴的克隆人，超电磁炮残次版本的御坂妹妹们也是可以的。
只要在2万种战场上击杀2万名妹妹们，一样能达到效果。
所以说...
[树状图设计者]你一路走好，茵蒂克丝干的漂亮。
......
“虽然姐夫大人好像知道好多关于御坂的事情，但是，御坂得到过命令，是不能够将这些事情说出来的，还请姐夫大人原谅。嘟，御坂虽然很想告诉姐夫大人，但是实在没有办法。”
御坂妹妹的表情变得微微有些失落，像是做错事情的孩子一样。
高瑟对此倒没有感觉到意外，只是普通的保密命令。
但是此时的御坂美琴。
“够了！！”
…。。