信任是一回事，本事又是一回事，嘉靖让他做这指挥使，本意是让他节制锦衣卫，去除掉江彬的影响，将锦衣卫整合起来，重新成为宫里最重要的力量。
可问题在于，朱宸上任之后才发现满不是这么一回事，一方面，嘉靖显然并没有给予他太多‘政策’，理由很简单，正德皇帝就是倚重厂卫，嘉靖皇帝登基，为了显示自己与正德不同，自然对厂卫摆出一副排斥的姿态来，又要马儿跑，又想马儿不吃草，这世上哪里有这么便宜的事？朱宸走马上任，面临的就是姥姥不疼舅舅不爱、下头又分崩离析的局面，再加上锦衣卫亲军本就掺杂了各种势力，内阁早就安插了人，勋贵们也都有自己利益，他固然想下重手整合，无奈何阻碍重重，却不得不作罢。
最后的结果就是，整个锦衣卫里头，许多人生出了取而代之的念头。