电子地图显示，这一层的核心位置叫做“生物基因库”，它就在那座雪山下方的一个山洞里。穿过那个基因库，就是超级电脑达瑞摩斯主脑存放的地方，也就是我们此行的最终目标了。
行走在这片充满了原始情趣和自然风貌的绿色大地上，我们倒不必担心自己会迷失方向。很显然我们的敌人为了让第二层的机械守卫者在运输车状态下能够顺畅通行，曾经一度在这里修建了一条足够它通行的宽敞道路。尽管这条路看起来已经有段日子没有使用了，道路中央疯长着的荒草已经快能没过小腿了，但对于我们来说，这仍然是条指引我们通往胜利的康庄大道。
在这里，我们仍然能遇到许多敌人，不过它们已经不再是那些手持各种枪械的金属脑壳的机械魔偶，而变成了生活在这片自然环境中的一些危险的野兽。在灌木地带，生长着不少防御力强大的刺背狼獾和攻击力惊人、并能造成撕裂伤害的硬颚蜥蜴，有时从那里还会爬出一些充满了毒素的巨钩荆棘蝎拦住你的去路。
密林中的主要敌人是那些獠齿野猪、强壮的洞穴熊和能够隐藏行踪的丛林斑豹，但最让人头疼的却是那些身手机敏灵活而又性情残暴的长臂狂猿。这种总是在树上攀援的动物总是三五成群地一起行动，并且每当你进入它们的领地时它们总喜欢用结在树上的那些巨大的坚果向你投掷。每当被它们投来的坚果砸得头破血流狼狈不堪的时候，我都分外地想念那把刚刚被我当成暗器扔出去的突击步枪——没了它的帮助，我只能举着盾走在前面做一个挨打的活靶子，完全没有还手的能力。反观黑暗精灵刺客红狼则比我强得多了，他一路随身携带下来的两柄手枪让他有了充裕的还击机会，而魔法师妃茵、恶魔术士丁丁小戈、矮人牧师长弓射日虽然失去了枪支，但这三个法系职业者本身就具有远程攻击的能力。在他们的一路掩护下，我们好不容易才冲出了那片森林。
哪条道路并没有进入沼泽，而是通向另一侧的草原。在这里，强壮的噬人狮和成群结队的斑纹狼是我们的主要对手，有时一些利喙兀鹰还会俯冲下来找我们的麻烦。不过这一小片草原上的王者并不是他们，而是一种叫做“捷足龙”的猛兽。它应该是一种爬行类的动物，身上披着一层坚固厚实的硬皮，奔跑的速度异常迅速，自身带有冲锋的技能，同时攻击力也相当不弱。不过这种厉害的生物多半只是独自游荡，最多也不过只有两三头结伴而行，因此对于我们来说，这些家伙倒也不算太难对付。
原始的自然风光、四处奔突的凶猛野兽、剑与盾的武器
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