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最终经过张天麟、孙元化、洛养性的商议，作为朝廷对郑芝龙的补偿，将淘汰下来的数百艘舰船拿出一半送给郑芝龙，作为他的私人财产。
另外一半船只朝廷将向郑芝龙等十八芝支付白银，作为购买的花销。
在张天麟的强烈要求下，郑芝龙才接受了朝廷的补偿！
之后，郑芝龙直接带着精简下来的一万人，近五百艘战舰去了澎湖，以及朝廷给他拨的五万两银子的港口建造费用。
完完全全的将这座岛屿留给朝廷，留下了目瞪口呆的张天麟众人！
他们明白，郑芝龙这是在向皇帝表忠心啊。于是他们联名向朱由检写了奏折，描述了郑芝龙的行为，一切请皇上做主。
郑芝龙走后，张天麟也就开始了他在台湾府的治理工作，孙元化开始台湾都司的筹建，洛养性开始将这里作为南洋的情报中心，开始情报工作。
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