做‘格致’。不过这个提议被允熥否决了。研究科学必须是真心喜欢的人，若是设立科举考试科目，招来的一定是一堆进士或国子监入学考试通不过的官迷，对科学研究有害无益。
这个提议被否决，百官倒也不在意，毕竟从一开始成功的概率就很小，并未再上折子；但对于另一件事他们可就十分在意、反应激烈了。敏儿身为女人，虽然是个公主，但怎能掌管格致院呢？虽然披上了她丈夫张学熙的马甲，但大家也不傻，实权在谁手里一眼就能看出来。众人纷纷进谏反对此事。
允熥当然不理，而且心里还有些纳闷：‘昀芷与无忌先是一同为印度三总督之一，现下又一并掌管北平府和宣府镇，你们怎么就视而不见，只盯着敏儿呢？’但不论文官们为何如此，他都不会在敏儿掌管格致院这件事上让步。文官们进谏了一阵，见宫里没有反应，也只能偃旗息鼓，承认现实。
与此同时，改造日本之事也在秘密进行。文垣重新回到理番院为副使，光明正大地盯着日本的一举一动，准备在有机会的时候动手。
已经成为大明总后勤部尚书、大都督府朱雀阁会议成员之一的朱恒实当然也卷入了谋划之中。允熥已经向他许诺，若是谋划成功，就让他恢复原日本皇族的身份，让他的孙子成为日本国王。面对如此诱惑，朱恒实当然竭尽全力为文垣谋划。
另一个卷入此事的原大明番国宗室同样十分高兴地参与起来。今年四十五岁的黎元澄此时为总参谋部左侍郎，负责谋划在必要时候出兵日本的作战方案。他或许是本着自己的国家完蛋了，也不让别的番国好过的想法，殚精竭虑思量同日本作战的方案，而且随时根据日本本土的变动进行修改。
经过十年的谋划，终于让文垣等到了机会。建业三十年，足利义持病逝。他去世前自己的儿子已经死去三年，因此在他重病后急需定下继承人；但足利义持不知为何，拒绝指定继承人。群臣经过商议，决定在石清水八幡宫以抽签的方式选出新任将军。义持死亡后，由他的四个弟弟梶井义承、大觉寺义昭、虎山永隆和义圆在石清水八幡宫抽签。群臣认为抽签代表了神的旨意，是最公正的方式。最后抽出来的人选是义圆。
但义圆若是继承大将军之位，违背了日本的许多规矩，因此有很多人反对。日本的局势很不稳定。
历史上，义圆先后两次改名，而且一年多后才正式加封征夷大将军，日本的局势才稳定下来。但这个时空，文垣不会给他局势稳定下来的机会，利用横滨的永安王朱孟炯笼络过来
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