。林林总总，即使只从建业元年开始查，不少人也够上了秋后问斩。而且还牵连出了不少其它衙门的人。
允熥自然不能将他们都下狱。都下了狱，原本效率就不高的各衙门会瘫痪的，他可没有朱元璋的气魄。当年郭桓案朱元璋将六部的官员一次干掉了九成以上，有些衙门只剩下两个人。允熥既没有朱元璋的气魄也没有他劳模般的工作热情，在刑部报上来的名单中挑挑拣拣，去掉了一多半，将剩下的人抓起来。好在刑部尚书茹瑺也知道不会都抓起来，报的名单只有他一人知晓，没有造成太大的动荡。
允熥自然也不会将他们都在深秋处斩。此时当然要严格依照《大明律》将他们全部定为死罪，可过几个月就找一个理由赦免他们的死罪，然后连同家人统统流放到汉洲大陆。已经分家的人运气较好，只牵连到妻儿；若是尚未分家的，整个分支都会被流放过去的。
贪功案也在紧锣密鼓的审问。由于张铨突然倒戈，使得案子很快被审问清楚。允熥定了宣宁侯曹泰与徽先伯桑敬贪赃枉法的罪名，废去世袭的爵位、免去所任的官职，子侄也都免去官职，贬为庶民；永定侯张铨也犯了贪赃枉法，可允熥以他‘有戴罪立功的表现’为由，虽然也废除世袭的爵位免去官职，可他的子侄保留了军职，也就是说只要他的儿子有本事，还可以凭借军功重新升上来。
张翼毕竟是开国功臣，作为一个封建王朝的皇帝显得太凉薄对维持统治不是好事，而且其情可悯，允熥就下旨废了他的世袭爵位免去官职，但并未废除他第三子张育穆的世袭指挥使，其它子侄虽然没了世袭，但也可以凭借军功重新东山再起。
允熥还打算使人宣扬：现下立功机会最多的地方是汉洲大陆，封在汉洲的藩王也不会在意某人过去犯下的错误，有本事就任用，有功就奖。鼓励他们的子侄前往汉洲。
以上四人身份贵重，允熥不好做的太绝，可在他们之下，五军都督府和兵部牵连出来的小虾米他是不会放过的，统统判处流放汉洲。
消息传到军中，果然将领们对于贪图他人的功劳十分厌恶，大多数人都支持允熥的做法，少数不支持的也翻不起波澜；这时军事改革还尚未涉及中下层，他们也没有反对，军中基本保证了稳定。
与此同时，都察院又开始查证五军都督府内曾经有过的其它枉法之事，查出许多案子来。允熥借用新查出来的案子扳倒了普定侯陈桓等人。陈桓同样是开国功臣，而且与耿炳文、张翼和曹震是此时硕果仅存的四个洪武年间加封世爵的一代功臣，
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