在运河上疏浚一些年久淤塞的地段，但是如果朝廷北迁，北京陡然增加的大批的官僚、家眷，乃至驻军，所需要的供给，现在的河运、海运要扩大数倍规模才成，至少目前，还不具备这个条件。
军事地理派说：北京太靠近北狄了，距边塞不足两百里，外无藩篱之固，内无战略纵深，一旦北狄入侵，破关而入，马放燕山，北京城下旦夕可至，置天子与如此险地，实在是太危险了。
还有些人担心都城北迁，到了赵王的地盘上，太子又要多一个竞争者，可这个理由不能明说，于是便随意加入一个反对派。冠冕堂皇地陈辞一番。
另外还有许多人出于个人、家族、故乡的利益，强烈反对迁都。因为江南文教发达。江南的士大夫也是最多的。所以江南籍的官员占了朝堂的绝大多数。京城迁走，无疑将触到他们个人、家族和故乡的利益。对此自然强烈反对。
不只是他们。包括当初追随洪武皇帝打江山的功臣勋戚们，同样大多出身江南，他们的家在这里，他们的根在这里，谁肯千里迢迢跑到北京去。再说，北京跟金陵一比，那繁华程度差了十万八千里，有好地方不呆，谁愿意到那穷山僻壤去定居。
民间的富绅、地主听到这消息也是强烈反对。当初朱元璋营建中都凤阳，强行迁徙了十万富户去凤阳，如果永乐皇帝迁都北京，少不得也要迁徙许多江南富户到北京去，难保其中不会包括他们。
他们家里要么有人在朝为官，要么与哪位朝中官员有深厚关系，这时八仙过海，各显其能，纷纷动用他们的人脉关系，在朝廷上发出了最强烈的反对。
还有那风水先生派，引用诸葛孔明的话说：“钟山龙盘，石头虎踞，上映紫微之垣，此帝王之宅。”大谈金陵风水如何的好，以此作为不应弃金陵而就北京的理由。
文渊阁大学士杨荣就是此中代表，不管他反对迁都的本意是什么，他给皇上的奏疏却是黑纸白字地写着：“天下山川，形势雄伟壮丽，格局宽阔，九星齐拱，万斗相映而成辉，可以为京都者，莫逾金陵。”
风水派这一反对，却引起了风水派内部的反对意见，他们对风水、易理，都有很深厚的研究，而且不大关心政治。他们不在乎皇上迁不迁都，也不理会别人为什么反对迁都，既然有人提到了风水，他们自然要发表发表自己的看法。
他们认为，“山管人丁水管财”。“山”代表背后，主宰健康和人丁兴旺，自然也包括国运，宜雄健浑厚，最忌背空；“水”代表前方，主宰事业和财富，
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