在彼得去世之前，王远博士的计划就开始正式运行了——不断有能源物质（魔晶），通过这个隐蔽而周密的系统，流向光明教会，流入飞船内。
按照博士的计划，以及计算机的辅助计算，这套能源收集体系，大概需要一万七千年左右，就能收集到飞船离开行星，按原程返回所需的能源——至于那个虫洞还在不在，就很难说了。
此后，这个系统虽然也遇到过一些小意外（譬如所罗门群岛的多罗所建立的魔法帝国），但始终还是运行得非常良好，直到距离收集满足够能源还剩两千年的时候，发生了一个意外
。
一名受北方另一种能量场辐射改造的当地人（圣骑士莱因哈特），进入了飞船所在的大陆，识破了光明教会的部分秘密，并且回到北方，开始谋划反击。
此后，光明教会主导了一场歼灭战，并且赢得了其后与北方辐射人种的战争。
然而，百密一疏，战后南北两方面在神子不在场的情况下，签订了能源配额条约。
随后，光明教会所在大陆，也开始出现反抗势力。
反抗势力的头目，通过破解彼得创造的魔宠系统，最终控制了一名神子，并且从这名神子手中，获得了大部分精神控制魔法。
事实上，到了这个时候，这块大陆上的土著们，所掌握的力量，已经比单单接受了辐射改造的神子，要强大得多了。
好在，彼得在建立神子系统时，留了一个心眼，每一名被辐射改造过的神子，在走出飞船后，都会立刻被一名前任神子洗脑。
所以，那名被反抗军控制的神子，对自己进入过飞船的事情，一无所知。
另外，由于该行星能量场中，涉及生物能量方面的模型，也就是所谓光明系魔法的模型，太过复杂，很难用当地语言描述，所以反抗军同样没有获得。
正是这一点，保证了光明教会能够继续屹立不倒，因为这块大陆的土著们，仍然需要神子展现神迹，来控制次大陆。
不过，王远博士的计划还是有了漏洞，在和反抗军妥协的过程中，光明教会不得不分出去一部分能源收获，以获得暂时的和解。
原本再需要两千年就能完成的能源收集计划，也被推迟到了四千年。
但是接下来，一个更大的意外出现了。
在南北大战发生三千年后，王远博士所在的冬眠舱出现事故。
博士在冬眠舱中临近死亡，脑部部分组织都开
…。。