核电站的修建之后，杨奇使用思维仪的时间就恢复到每天五个小时。杨奇将这五个小时全部用来编写操作系统的代码，每天能够编写500万行的代码。
杨奇一直这样坚持了10天，然后这个长达5000万行代码的操作系统终于完成。接着杨奇利用科技推演系统对这个操作系统的代码进行推演，结果就在里面发现了上千处的BUG。
一般来说，每个刚刚出现的操作系统中就会存在大量的BUG，所以在新的操作系统上市之前都会进行内测，希望能够发现里面的BUG，并将它们改正。不过就算是这样，一个新系统上市后也会被发现非常多的新BUG，使得这个新系统非常的不安全，甚至一些BUG从这个系统在市面上销售到退市的时候都没有被发现。
所以杨奇的系统尽管出现了一千多处BUG，但是他并不着急，而是慢慢的修改这些BUG。一直到三天后，杨奇才将这些BUG全部修复，这个光子电脑的操作系统就全部完成了。它虽然不是最先进的，功能也不一定完善，但是它一定没有BUG，是最安全的系统。
相比之前人造鲸鱼和超级核电站的智能控制系统，光子计算机的操作系统就复杂得多。所以智能控制系统能够在很短的时间里编写出来，但是操作系统却需要花费非常多的时间才能完成。
而就在杨奇研究光子计算机的时间里，燕飞利用小型生产车间再次生产出一条人造鲸鱼。这条人造鲸鱼同样完美，在安装好智能控制系统之后，就已经进入海洋中，提取海水中的铀元素去了。然后在得到杨奇传过来的关于光子计算机的生产计划后，就开始在小型生产车间中生产光子计算机。
光子计算机有别于人类之前的所有计算机，所以它的生产过程非常复杂。不过好在生产它的原材料非常普遍，获得它非常简单。同样的，生产这台光子计算机，里面也要加入黑金元素，只有黑金元素，才能大幅提升光子计算机的性能，让它达到世界上最先进的水准。
所以就在杨奇将光子计算机的操作系统编写出来之后，燕飞利用小型生产车间已经生产出了第一台超级光子计算机。
按照杨奇的估算，这台超级光子计算机的最高计算速度能够达到恐怖的每秒十万亿亿次。而且因为光子计算机能够进行并行计算，所以它的实际运算速度至少还要在这个基础上提升一倍以上，也就是每秒二十万亿亿次。
世界上最快的超级计算机本来是华夏的神威.太湖之光，它一直蝉联世界上运算速度最快的超级计算机
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