朱俊先与黄巾军波才部作战，失败，与皇甫嵩退守长社，波才率大兵围城，当时，城中兵少，众寡悬殊，军中震恐。
皇甫嵩和朱俊二人安慰部下，并打算使用火计，当晚大风骤起，皇甫嵩命令将士扎好火把登上城墙，先派精锐潜出围外，纵火大呼，然后城上点燃火把，与之呼应。
皇甫嵩领兵借此声势，鸣鼓冲出，黄巾缺乏战斗经验，惊慌散乱，被迫后撤，这时，朱俊暗中联络的各地义军也已经到了，于是皇甫嵩、朱俊合兵，乘胜追击，黄巾军数万人惨遭屠戮。
接着，皇甫嵩又和朱俊一起乘胜镇压汝南、陈国地区的黄巾军，并追击波才、进攻彭脱，连连取胜，平定了三郡之地，此后，皇甫嵩上表朝廷，推功于朱俊，朱俊进封为西乡侯，迁镇贼中郎将，奉命平定中原黄巾。
此时中原黄巾只剩下汇聚在南阳的张曼成所部了，张曼成拥众数万，杀南阳郡守褚贡，屯驻宛城数月，后任南阳太守秦颉阵斩张曼成，但宛城仍为黄巾所占，南阳黄巾大部扔在，余兵举赵弘为帅，约有十数万人之众，皆是勇士。
而朱俊和南阳太守秦颉合兵，及中原各地义军，也不足两万人，不过朱俊仍旧率军进击赵弘，从六月直到八月，绵延两月有余，始终未能取胜，朝中有人上奏，要召朱俊回京，幸得司空张温上疏劝阻，才不至于功亏一篑，朱俊之后得计，先阵斩赵弘。
不过剩余的黄巾军又以韩忠为帅，仍然占据宛城，朱俊兵少不敌，于是解散城围，扎下营垒，筑造土山，面对城内，鸣鼓呐喊，摆出进攻城西南的态势，黄巾军全都赶赴应敌，朱俊却自率精兵五千，进攻东北，将士鼓勇，登城而入，韩忠退守小城，惊惧非常，请求投降。
朱俊拒之，放开城围，韩忠见围解，果然引军出战，朱俊乘势进击，大破其军，追击十余里，斩杀韩忠等人，黄巾余众又以孙夏为帅，还驻宛城，朱俊再攻，孙夏败走，朱俊纵兵击杀数万，至此，中原黄巾破散流离，为朱俊勇名所摄，不再反叛。
要知道，中原黄巾巅峰之时，可是也是百余万众，和青州、冀州都是一样的，可是最先平定，平定的最好的却是中原，青州的百万黄巾和冀州的百万黄巾可都是绵延了数年时间。
朱俊之名，已经勇传天下，被誉为大汉柱石，当然此时大汉柱石还有皇甫嵩，两人可被称为帝国双壁，卢植则是大儒，和他们两位奔着大将军之位有所不同。
朱俊若丧，那么中原黄巾定会再次乱起，南阳十余万被他勇名所摄，不敢反抗的黄巾
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