旅做为商毅的护卫兵力，而海军部也调集了以一级战列舰岳飞号，和三级巡洋舰四艘、四级驱逐舰二艘、五级护卫舰二艘，另外加上辅助战船四艘，一共十三艘舰队，成商毅的专门御驾舰队。
御驾舰队首先随南路军进攻九州岛，然后再到达本州岛，和北路军汇合，在本州岛指挥作战。
而在对荷兰方面，给吕宋曾派南洋舰队第三分舰队，帮助李华梅舰队，首先守住吕宋这一线，阻止荷兰再援助曰本，并且在吕宋积累物资、粮食、弹药，为下一步进攻巴达维亚，驱逐荷兰做好准备。
另外冈萨雷斯伯爵本來是打算返回欧州,一听说中国要进攻rì本,也不觉勾动了一颗老军人的战斗情绪,因此也决定暂时停止回国,也参加这一次战斗。商毅对此也不会拒绝，于是在御驾亲征的人员中，又加上了冈萨雷斯伯爵的名字。