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当然现在马尼拉的贸易来往,是由中国人来主导了，因此商毅也委任张庚秋，从当地华人中选出十几名较有声望和影响力的人，付责管理马尼拉与其他各国的贸易来往，收取关税等等，同时也告之各国，现在吕宋地区己经由中国的南京政府接管了。
马尼拉的内政只是一方面，另外还有对外的战争并未完全结束，现在中华军控制的只有吕宋岛，而在呂宋群岛的其他诸岛，中华军还没有真正来得及染指，而且就是在吕宋岛，中华军实际能够控制的，也只是马尼拉城和周边的地区，其实只占了吕宋岛的极小一倍份。在中华军控制以外的地区，还散布着大量的传教士，而吕宋岛上的各土著部族，还没有向中华军正式臣服。另外还有从马尼拉城逃跑的大主教，也还下落不明，这也是一个极大的隐患，必需清除掉。
因此商毅也命人四处打听，大主教弗朗西斯科的下落。同时也派出部队，去接收西班牙殖民者在马尼拉地区开避经营的各工厂、农场、庄园等资产，首先进行清点查封，登记造册，准备进行拍卖。并且派人回国通告国內的各大商家，有兴趣的人都可以来马尼拉来，拍实大会将在二个月后进行。
三天之后，马尼拉地区的生活秩序基本恢复，八成以上的华人也都定居下来，还有少数店铺也都开张营业，而且马尼拉地区的工厂、农场、庄园等等也基本被中华军清点査封，一共有四十三处。
而这时在棉兰老岛的天主教耶稣会的马尼拉教区的付责人，奥利维拉主教带着几名传教士，在郭纳爵和阳玛诺的陪同下，来到吕宋岛，参见商毅。
在中华军当到马尼拉的时候，奥利维拉听从了中国的传教士的劝告，对这场战争暂时保持中立，因此对大主教弗朗西斯科的号招釆用拖挻战术，不过耶稣会右马尼拉大教区的势力并不大，而且传教的地方也十分偏远，弗朗西斯科也并没有对他们抱以多大的希望。不过奥利维拉对中华军并不看好。
郭纳爵和阳玛诺第二次来到棉兰老岛的时候，中华军还沒有攻下马尼拉城，不过奥利维拉得知中华军己经登陆马尼拉，并攻占了圣地亚哥堡之后，也对中华军在马尼拉的前景发生了改变，认为有必要亲自到吕宋岛来，观测一下形势。那知等他到达吕宋岛之后，才知道马尼拉城己经改旗易帜，成为中华军所有。
虽然奥利维拉也惊亥中华军的战斗力，这么快就拿下了马尼拉城，但同时也不禁暗自庆幸，好在是自己极时来到吕宋岛，才能够抓住这个大好时机，因此也在阿科尼亚的引见下
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