杀进港口之后，他们根不就无法抵抗，也只能束手就禽，乖乖的投降。而港口里的船只，当然也全部都成为伏波军的战利品了。
整个战斗的用时还不足两小时就结束了，比商毅提出的“天晚之前，攻占圣地亚哥堡”的命令，足足提前了二三个多小时。在占领了圣地亚哥堡之后，商毅、成钢、李华梅、还有英国东印度公司的三名代表也都相继登岸，进入了圣地亚哥堡里。而士兵也正在忙着淸理战场，查点缴获的物资等等。
在攻占圣地亚哥堡的战斗中，中华军的伤亡仅仅只有十二名士兵。不过由于西班牙军撤退的及时，因此伤亡到也不大，只有二百多人，而且基本都是死于先期炮火中。另外还抓获了八百多名俘虏，主要都是留守战船的水手，以及城堡里的其他杂役人员，成份到十分复杂，来自非州、印度、巴达维亚、果阿、马里包括菲律宾土著都有，但基本没有欧州人。
不过圣地亚哥堡的规模并不大，又是一座要塞，里面并没有居民定居，因此缴获的粮食、金银等物资并不少，但在马尼拉港里的九艘战舰，还有十五艘其他的船只，却让商毅觉得己经够了。这九艘战船中，包括与李华梅交战的圣卡西号、弗拉门戈号这两艘七百吨级的大船，另外七艘战船为一艘六百吨级、一艘五百吨级，四百吨级和三百吨级各两艘，而十五其他的船只，也都在三百到七百吨之间。就是这一批船只，其价值就绝不菲。
同时伏波军又在马尼拉港的东南方发现了一间造船厂，虽然这时造船厂的人员跑了大半，但还是有少量留守人员，同时厂房、船坞、设施都一应齐全，而且还存有大量造船的材料。规模虽然没有商毅在杭州建立的那个造船厂大，但也相当可观，另外在船坞里，还有六艘在建，或是维修的船只。其中就包括在与海盗舰队交战幸存下来另两艘战船，塞尔维亚号和哥伦布号。
一个造船厂，这可是一个意外之喜，商毅也不禁大为高兴，仅仅只是攻下了一个圣地亚哥堡，就收获巨大，也可以想像，如果再攻占了整个吕宋岛，还会有多少惊喜在等着自己呢？不过想想也是，西班牙人在马尼拉经营了近百年，那能沒有一些好东西呢？自已占领吕宋岛之后，这些东西可就都归自己所有了。
随后商毅也立刻下令，安抚留在船场里的工作人员，告诉他们现在吕宋岛将由中国统统，但只要服从自己的命令，就可以保证他们的生命安全，而且在船厂工作，各种待遇照旧，并让他们去招回其他的工人等等。
当然目前战事还是第一位的，攻下了圣地亚
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