但商毅心里十分清楚，清军的进攻才只是刚刚开始，都是试探性的，而且还没有动用火炮火枪等火器，估计是还没有运到，因此真正的危胁，还在后面，决不能以为清军就是技止此尓。
而且通过对城外清军的侦察，商毅也知道，这几天清军虽然没有现进攻，但也沒有闲着，而是在加紧时间砍树造筏，而且还在长江边上征集到大量的船只，显然都是在为下一次进攻做着准备。也可以想到，一但清军再次动进攻，无论是强度还是规模，都会比这几次要大得多。
于是商毅也趁着这个机会，向南京的居民下达了全面动员，号招百姓一但清军攻破南京城墙，不分男女老幼，匀有守地卫疆之责，要坚持抵抗到最后一刻。
当然商毅也不会一味的消及在城中等着清军进攻过来，虽然寻机歼敌主要是由外线的成进付责，但在内线防守，仍然也要以我为主，积极争取主动进攻的机会，牢牢撑握住战场的主动权，这是商毅自从接受军事教育以来，一直被灌途的战术战略思想。
不过现在清军虽然没有再次动进攻，但对营地的防守还是十分严密，层层设卡，步步设防，双方生过几次百人规模的小战斗，虽然商家军利用射程和火力上的优势，一直都占据上风，但一直没有动一次中大规模进攻的好机会。
岸上不行，商毅的目光，也转移到长江上。
根据侦察兵提供的情报，清军的水军驻扎在龙江关，也就是著名的龙山船厂，征集来的所有船只几乎也都停泊在这里。如果能够催毁龙山船厂，重创清军的水军，不仅能够消除清军从长江上的支援，同时还能切断清军长江两岸的连系，而且商家军还可以通过长江，对清军的后方动突袭，可以说是一举多得。
在水面上，商家军的海军占有绝对的优势，虽然第四、五分舰队沒有战列舰级的战船，但和清军临时征调的江船相比，绝对还是巨人一级的，而且正好都可以在长江中航行，在火力上更是有压倒性的优势，因此完全可以打一场强攻战，于是商毅也找到海军的统领黄震，商议这次进攻的计划。
而就在商毅正在制定进攻龙山船厂的计划的时候，也收到了成进的飞鸽传，原来成进己经寻找到了一个战机。
阿济格的大军逼近南京城下之后，付责保护他的侧翼是觉罗巴哈纳，总计兵力约有四万左右，分别驻守在宁国府、高淳、溧水等地，大体呈南北纵列，挡住了从广德通向南京的道路。但总兵力其实还没有商家军的外线兵力多。
当然这也不能怪阿济
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