里也十分淸楚，整个南京朝廷，根本就是烂泥扶不上墙，而皇帝朱由崧，甚至连刘阿斗都不如，至少刘禅还知道把朝政大权全都交给诸葛亮去处理，等诸葛亮死了以后，才开始信宠黄浩这样的奸邪之辈当然在黄宗羲的心里，诸葛亮就是指的东林党，而黄浩的角色，自然是由马士英来扮演了而至于朱由崧为什么要信任黄浩而不信任诸葛亮的原因，却被黄宗羲直接无视掉了
其实王夫之也是十分精明的人，他投靠商毅也有一年的时间了，自然也能看得见，商毅的一些做法确实并不符合为臣之道，而且商毅对南京朝廷，也只是表面恭顺而己，实际是我行我素，完全就是割据一方的做派但王夫之心里也清楚，这要怪也只能怪南京朝廷太不整作，太不争气了要想指望在南京朝廷的领导下抵抗清军，那是痴人说梦,还不如让商毅一个人甩开南京朝廷独干,说不定还有几分把握
王夫之的思想虽然也维护明朝的正统地位，但他毕竟和黄宗羲的正统东林出身不一样，只有一个举人的功名，在投靠商毅之前，跟本就是一个平头百姓，因此在思维方式也和黄宗羲首先站到朝廷的立场去想不一样凡事先考虑大局，而不是朝廷的感觉和忌讳
何况商毅做事情虽然亳无顾忌朝廷，但在大面上对南京朝廷还是十分恭顺的，只要不是像上一次王维如那样来和他争夺浙江的权利，商毅对待南京来的诏书、圣旨什么的，还是完全按照礼仪来办，比起左良玉或是江北四镇那样飞扬拔扈，己经算是好了许多，因此也让王夫之为自己的决定找到了一些理由而商家军在山东取得的胜利，也坚定了王夫之的想法让商毅当一个割据的藩镇，也总要比彻底亡国好
另外在王夫之的潜意识里，只要不是让满清占领天下，就算是明朝的灭亡，也并不是什么不能接受的事情，只不过和历史上任何一次改朝换代的鼎革一样罢了说白了就明朝灭了只是亡国，而让满清在原坐稳了江山，那就是灭汉人的天下了
黄宗羲不是不明白王夫之的意思，他现也确实无法来用私造军器的罪名来指责商毅，相反商家军也确实是整个南方唯一一支有能力和清军作战的军队，而且从一定程度上来说，商家军其实和东林还是同一条战线但不知怎么，黄宗羲总觉得心里沉甸甸的，怎么也放不下来
第二天黄宗羲就向商毅告辞，回到了南京虽然在朝堂上，黄宗羲并未说什么，只到在晚上和吴甡、钱谦益私下交谈时，才全盘托出
但吴甡、钱谦益对此都没有说什么，因为两人心里都明白，东林现在还能在南京朝廷
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