他想了一个简单的办法，那就是将权力分散，建立完善的监督机制，比如一县，县令掌管一县行政工作，但不再拥有审案的权力，查案审判将交由县丞，刑部直管，县兵以及各地乡镇民兵有县尉管理，兵部直管，这三个官职县丞与县尉级别一样，县令高半级，但没有指挥管辖权，相互独立。
除此之外，每一级地方还设有监察御史监督各地，监察御史独立于地方，任何人无权指挥，只对皇帝负责。
为了更好的加强中央集权统治，叶晨启用了锦衣卫这个部门，规格与明朝差不多，分为东南西北四大镇抚司，职权各不相同，拥有监察、逮捕、审问、收集军情、策反敌将等等功能。首领还是叫锦衣卫指挥使，由宫中皇帝亲信女官担任，直接向皇帝负责。