中戴士衡、御史汪以时曾上书，声称「南兵」不可能发生兵变，王保故意诬陷，应该按罪论处。但御史马文卿随即上书保护王保，兵部尚书石星也上书附会，最终，朝廷认定南兵叛乱，王保平变有功，加官进爵。到后来，兵部尚书石星下狱，身死牢狱。
自此年后，张居正、戚继光一代的风云人物自此风消云散。
「已经身死。」
韩鑛不了解这一个经手人的下场，但是孙承宗很清楚，这是军门之内的一场大争斗。
「朕下罪己诏吧。」
此话一出，两位都有点瞠目结舌。这位登基以来，都是强硬不屈的主，无论是针对权贵王爷，还是士林文人，看似公开平和，其实内心执拗。却没有想到今日会说出如此言语。….
「此事对戚家军不公，也对于为大明流血的将士不公，无论是当时兵部尚书石星、还是蓟镇总兵王保，万邦有罪、罪在朕躬。朕也不能去怪罪万历先皇。所以，错了就要改，也应该给戚继光、戚家军一个说法。」
孙承宗虽然也觉得不妥，但是反对的话却是说不出口。
韩鑛倒是直接劝解说道：
「陛下能有此自省之心，那是国家之幸、百官之福。只不过此事涉及万历先皇、也涉及朝廷众多重臣，陛下无须至此。」
「不！」
朱由检站了起来，回答的很坚定。
「朝廷又难，国家有灾，自然需要忠臣能吏。可是忠臣能吏为国解难之后，朝廷却以污蔑的形式，泼脏水到忠臣身上。首辅，长久以往，何人愿意做忠臣，忠臣又何以愿意到朝堂？」
「相对戚家军，朕这点罪己诏又算什么？」
「陛下！」
孙承宗走了出来，整理了自己的衣服，双手并举，行大礼向朱由检跪拜了下去。
「臣为戚家军谢陛下！为戚少保谢陛下！」
「平身吧。」朱由检拍了拍孙承宗的肩膀。
「督师选一个日子，朕亲自往节烈塔，安放戚少保灵位。顺便宣布，由军部结合新的武器，按照督师的建议，正式宣布朝廷于泉州重建戚家军！这也将是大明第一支以姓命名的军队。此后，朕当然也希望有一天能有以督师之名为名的军队。」
「喏！」孙承宗有点激动，声音都有一点颤抖。
「陛下！」说完了这些，孙承宗倒是有点不好意思的说
道。
「戚家军也并非没有后人。当时尚有戚家军后辈之女，名
…。。