留精锐三万人，编成三个师。郑克臧一一任命了师长，打算以这三个师为种子，重新编练至少六万陆军。
当然东岸顾问不太看好他的这种想法。六万陆军如果是按照现在新军的配置的话，福建财政是无法承担的，即便他们通过海外贸易获得了大量金钱，但这依然不可能。要知道，福建还养着一支规模同样不小的海军呢！
老实说，多年来福建的海军其实一直是在萎缩之中的。这其实也很好理解，郑芝龙时代陆上没什么大的根据地，陆防开支很小，大部分经费都砸在水师身上。但在据有全闽之后，情况就大不一样了！他们西边是顺国核心省份江西，两省之间有着漫长的边境线，需要屯驻的兵马很多；而在南面呢，他们曾经为了潮州府与广东李氏大打出手过，现在潮州虽然归了李元胤，但只要郑氏一天没有放弃入侵潮州的野心，那么就少不得要在这里屯驻大量兵马，准备很多战争物资；他们唯一相对安宁点的边境，大概是其北部与鲁王交界的地方了，基本上非常松散，兵马也很少，只有区区三千余人。
所以说，福建政权的陆上防御压力是非常大的，开支也很大，不得不大量压缩海军方面的开支。当然说压缩海军开支是不准确的，毕竟福建水师的经费就绝对数额而言并没有显著减少，但问题在于比重大大降低了，而且现在搞正规化后，开支也急剧增长。
举个例子，以前郑芝龙时代的福建水师，是以少数职业官兵为骨干，辅以大量的渔民。这些渔民平时在家里种地打鱼为生，这并不需要郑氏支付任何费用，战时则被征召起来，架着自己的船只到指定地点集合，郑氏核心的职业官兵给他们发放武器装备，指挥他们作战，这个时候才会产生费用。另外当时还有很多中小型的海盗组织，他们平日里也是自己管自己，战时可能会追随郑芝龙出战，但这部分的开支其实并不重。
而郑氏在取得福建全省后，开始大搞正规化，那么一切就都不一样了。福建水师的职业官兵人数大大增加，维持费用自然也大大增加。所以说福建水师的规模虽然比以前缩减了太多太多，但开支却有增无减，只是在军费中所占比例降低了不少罢了。
福建水师现在也进行了改革。在刘国轩这个水师第一人被抄家灭族之后，郑克臧在东岸顾问建议下，将全闽水师编成了两部分，即以小船、非专业战舰、杂号船只为主的海防舰队，一位郑氏族人担任了舰队提督；另外，从东岸购买的战舰、自己仿造的战舰编成了大洋舰队，郑克臧任命了曾在库页岛学习战舰驾驶、操炮技术的军官黄
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