一男两女三个人为中心展开的故事。其中主角之一就是被自己破坏了演唱会的巨星雪莉露。
然后是此时已经混进疏散人群找不到踪迹的绿毛妹——蓝花·李，以及全剧中的男主角，刚才那位米歇尔的同伴，此时正在出入口那里帮忙疏导人群的，在朋友中有着‘公主’称号的艺伎世家公子——早乙女有人！也叫阿尔特。在机缘巧合下被卷入了战斗，成为了机师。
有一个敌人，是种名叫Vajra的虫型生物，并且也和虫群生物一样，有着族群系统和强悍的进化能力，且拥有一个母体。
体内可以产生一种奇特的水晶物质，可以用来开发直透空间断层的折叠空间跳跃技术。
当然，这是指后期。至于前期，他就是人类的生死大敌！有着众多的殖民船队因为他们的袭击而沉没，成为宇宙垃圾。
Macross Frontier上的人自然不想自己的船成为下一个，但却架不住人类当中有叛徒和野心家，因此一次又一次的袭击接连不段的找上Macross Frontier，并为此造成了大量的人员牺牲。
直到名为蓝花·李的女主角察觉到自己真正的力量。
——可以用歌声与Vajra共鸣，影响它们的行动。
套路是不是很熟悉？很有种林明美、巴神再世的感觉？
所以最后的情况可想而知，肯定是在经过一番大战之后，宇宙重新获得和平，人类与天顶星人还有Vajra实现了和平共处，宇宙和谐一片，共同开创美好的新未来。