果兴阿想象中的明治天皇，拥有绝对的权威，在日本一言九鼎，是一个中国皇帝一样的九五之尊，但是实际情况却并不是这样。明治政府是由西南雄藩出人出钱建起来的，这帮维新志士连自己祖辈侍奉了几百年的藩主都不当回事，怎么可能全心全意的忠于明治这个少年。所谓的天皇依旧不过是一个傀儡而已，明治政府的本质是公卿集团和维新志士的共治集团。
天皇至高无上的地位，完全是为了打击幕府武士集团，以及安定各地民心搞出来的，实际意义并不大。不过因为公卿们并不团结，维新志士也分成了好几个派别，所以大家需要制衡，天皇便又有了一个裁判的位置。大家干起来的时候，还需要天皇圣裁，所以天皇也就比原来多了那么点权利。
当然日本也不缺理想主义者，比如西乡隆盛。一代军神西乡隆盛，大大不同于大村益次郎、大久保通利、伊藤博文那样的政客，他是个很传统的人，他也是真心的忠于明治天皇。年少的明治天皇，在一帮军阀、政客之间惶恐无措的时候，便是西乡隆盛成为了他的良师益友，一点点把他变成了一个合格的天皇。
果兴阿第一次征伐日本之后，德川庆喜、松平容保等人的幕府势力复起，给了公卿和维新志士们极大的压力，这又让天皇的权利得到了增益。而且很凑巧，天真的征夷大将军德川庆喜，以及士为知己者死的松平容保，都是忠于明治天皇的，这就更加壮大了明治的势力。政务改革上明治依旧只能靠边站，但是大的国策他还是有一定发言权的，比如被果兴阿逼入绝境的时候，大家便都听明治天皇的，当然也可以理解为他们让明治背锅。
不过良师益友西乡隆盛，曾经的敌人德川庆喜，都不是明治天皇最信任的人，他真正的亲信是宫中集团。所谓宫中集团，狭义上说是担任过宫中顾问官职位的官僚，广义上讲就是明治的帝师群体，以及明治本人比较信任的一些非主流高级军官。这些人声名不显，但个个都非等闲之辈。明治目前最倚重的三人便是，出身土佐藩的维新志士土方久元、谷干城，出身熊本藩的国学大师元田永孚。
土方久元是难得的能臣，原本是三条实美的亲信，促成萨长同盟他也没少出力。可是明治政府建立之后，他的日子过得就很一般了。公卿们拿他当维新武士，维新派又拿他当公卿们的狗腿子，两边难做人的土方久元，只能得到闲职，根本没办法展现自己的才能。不过闲职也有闲职的好处，土方久元就混进了御所，与明治小天皇混到了一起，成为了天皇的第一亲信。
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