就如之前他在淄川、章丘对待那些家族一样，该清理整顿的还是要清理整顿的，主要就是田地，把侵占的田地给收回，私采的矿山等登记，商铺作坊必须如实申报登记，领取部贴执照，照章纳税。
孙孝恩跟朱以海诉苦，崇祯以来，山东没有一日之太平。
“崇祯十二年，清兵绕过北京南下，攻入山东，破济南城，大肆抢掠，当时济南被杀被掳的壮丁就有八千八百五十一丁之众，民间牲畜被掳尽，此后几年，牛一头直二十两银，大者值三十两银，贫者相傅而耕，率六七人曳一犁，日三四亩，已困疲。”
鞑子屠戮抢掳山东，还造成了瘟疫爆发，死者无数。
“十六年，清军再攻山东，虽未破济南，却攻破了泰安，连许多世家望族也遭受灭顶之灾，千金之家有丐于市，整个山东被践踏成人间地狱，驰驱两千里，人烟断绝······”
孙孝恩告诉皇帝，并不是山东士人无骨气无节义，鞑子入关前的两次攻入山东，山东也有无数官吏将士，士绅百姓抗争。
十二年破济南那次，济南兵因被杨嗣昌调走，城中空虚，仅乡兵五百、莱州援兵七百，但巡按御史宋学朱带领下，城中官吏百姓仍然全城坚守，虽仅守十日城破，但没有一个逃跑的。
从巡按，到布政使，再到按察副使、知府、知县、兵备道、盐运使，甚至是教授，所有人慷慨赴死，为国捐躯。
滨州杜氏、新田王氏两大家族，也都是十分英勇。
十五年，清军犯滨州，告老还乡的原山西太原通判杜律，立即组织城中的杜氏家族子弟守城，满怀激烈，视死如归，最后城破而死。
举人杜赋，城破后不甘从贼，怒骂清兵而死，其六子俱被害，杜家的子孙一个接一个前仆后继的冲上去杀鞑子，几乎满门灭绝。
清军攻下滨州后过新城，新城王氏也满门守城抵抗。
王氏甚至早在孔有德叛乱时，时任保定同知的王象复在家养病，闻讯跃床而起，慷慨陈词，吾家世受国恩，岂可不去，于是召集乡民，与儿子一同碟血城头，城陷后父子双双被俘，不屈被杀。
清军来犯，王氏家族上下仍然上下同仇敌忾，表现空前壮烈，那些平日里风花雪月吟诗做画的子弟，纷纷拿起弓箭长枪，坚守城池，这次兵祸，新城王氏遭受重创，不仅家族祖宅大院被洗劫一空后被清兵焚毁，家族子弟也三十多人死难，家族年轻一代的精英几乎死绝。
也正是因为这次兵祸，让本来王象复那代
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