1928年9月，国民党二届五中全会在南京召开，宣称全国进入“训政时期”，由国民政府执行训政职责，并决定以五院制组成国民政府。
同年10月，南京国民政府公布《中华民国国民政府组织法》，规定国民政府总揽中华民国之治权，政府由行政院、立法院、司法院、考试院、监察院组成，设主席1人，委员10~12人，国民政府主席兼任陆海空军总司令。
此后于1932年1月、1947年4月、1948年5月对国民政府机关及人员安排进行了调整、调换。
国民党主政的国民政府实行“五院制”。
即国民党训政时期的行政制度，规定由行政院掌理最高治权，国民党训政的意志通过行政院得以贯彻执行。
1936年行政院内设部和委员会与1928年《行政院组织法案》已经有很大的调整与变化。但国民政府中央及其人员数每年其实都有变化。
省政府是国民政府地方最高行政机关。“省置省政府，受中央之指挥，综理全省政务。”。省政府由7至9人组成省政府委员会，省政府设立主席1人，由国民政府在委员会中指定。省政府下设秘书处、保安处和内政、民政、财政、教育四厅。同时，省政府还设行政督察专员公署作为省的辅助机构。
南京国民政府时期，废除了北洋政府时期的“道”，实行省、县两级行政管理体制。
但是，由于省管县的管理幅度过宽，需要在省与县之间设立一个督察机构。1932年8月行政院颁布《行政督察专员公署组织条例》以后，各省区按照规定规范督察机构名称、组织机构设置。
1936年行政院又颁布《行政督察专员公署组织暂行条例》，专员公署遂正式成为省、县之间的一级辅助省政府的行政机构，在各省普遍建立。
专员由行政院院长或内政部部长提请国民政府任免。专员承省政府之命，推行法令并监督指导，既统筹辖区各县市行政，又兼任该地区保安司令，指挥监督辖区内的保安团队、警察及一切武装自卫民众组织。
从法理层面上看，专署与县之间的关系体现在行政监控、人事监控、财政监控、行政统筹、政治沟通、直接的军警领导权诸方面。
显然，行政督察区与北洋政府的“道”是有差别的。前者是督察专署，后者是一级政府。
但是白面上其实是有两套系统的，特别是湖南和长沙这样的后方战略要地更是如此。
除了政府机
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