隋炀帝的旨而不敢继续进攻，按照上一个旨意，任何行止都要奏请，赶紧写个折子上奏隋炀帝，这一来一去，少说两三天过去了，等隋炀帝回复命令了，城里的高句丽军已经准备好了防御，再次开始抵抗。这样的情况重复了好多次，隋炀帝仍然不醒悟。所谓一鼓作气再而衰，三而竭，即使之后隋炀帝醒悟，亲自到前线指挥，但士气已经衰落的隋军在辽东守军的顽抗下又僵持了一个月也没能拿下。高句丽的其他城池与辽东城的遭遇相仿，都没能拿下来。
中军尚且如此，其他路的进攻，也是一样的糟糕。
水路由当时的右翊卫大将军来护儿率领，战船相接数百里，声势浩大。进入浿水，与高句丽军相遇，轻松击破。来护儿便想乘胜进攻高句丽的城池，副总管周法担心轻敌冒进，尚希望等其他隋军到达后一起前进。来护儿不听，选取精兵四万，进至高句丽的城池下，高句丽诈败，来护儿中计，高句丽伏兵趁机攻击隋军，来护儿大败，四万士卒还者不过数千人。
高句丽军队追击到隋军船所，周法尚整军列阵待之，高句丽军才退去。来护儿率军返回驻扎在海浦，没能完成既定的接应任务。
陆路方面，脑残举动也是比比皆是，当时军队人马都携带百日所用的粮草，还带着排甲、枪槊以及衣资、戎具、火幕，太沉重以致于难以负荷。器械太大太明显丢弃不掉，士卒都在幕下掘坑埋了粮草，结果才走了一半路程，粮草已经快要耗尽。就在这个时候，高句丽派其大臣乙支文德来诈降，观察隋军的虚实。
大将于仲文想要趁机捉住乙支文德，但是被刘士龙阻止。于仲文放走乙支文德之后，又后悔了，决定追击乙支文德。当时隋炀帝命令驻军受于仲文节度。于仲文、宇文述等九支军队渡水追乙支文德。乙支文德看到隋军将士有饥色，所以想让他们更疲惫，每一接战就诈败、撤走。宇文述一天之内七次战斗取胜，继续前进，渡过萨水。乙支文德再次派使者诈降。宇文述看到隋军士卒疲弊，不能再作战，而平壤城险固，估计难以迅速攻下，只好撤退。
军队返回时，高句丽军从四面攻击，宇文述等人且战且行。到达萨水，隋军渡河渡到一半时，高句丽攻击隋军后军，隋朝左屯卫将军辛世雄战死，诸路隋军都溃败，无法禁止。将士奔逃一日一夜到达鸭绿水，行了四百五十里。王仁恭为殿后，击退了高句丽的追兵。渡过辽河时，这一路军马有三十万，等到返回辽东城时，只剩下不到三千人，物资储备兵器军械巨以万计，也丢失殆尽，全部成为了高句丽的战利品。
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