在神奇宝贝研究学院重新遇到小智等人，智辉就算是想把他们甩开，也暂时没有机会，只好等着到枯叶市，再把小智甩开。
不过带着小智，智辉也的确感觉到了一丢丢的不方便。
遇到好的神奇宝贝，不好意思跟弟弟抢。
然后这一路上吧，还真就遇上了几只好的神奇宝贝。
不是别的，就是动画里的妙蛙种子、小火龙、杰尼龟，小智的元老御三家，后期战斗力，一个比一个过分，智辉看的心动，可是结果，自然是一只都没抓地给了小智这个到现在都还没有凑齐六只神奇宝贝的家伙。
不过，因为智辉加入的缘故，剧情还是发生了不小的变化，动画里，小智收服了杰尼龟军团的老大，然后剩下四只留在当地成立杰尼龟消防队。
可是因为智辉插一手的缘故，老大还是给小智收服了，可是剩下四只也没留下来，小霞小刚各要一只，小次郎也手快地抢了一只，最后一只，送给科拿了。
你说，为什么智辉不收服啊？
杰尼龟老大，江湖方丈哥一心跟着小智，你让智辉收他手下，以后两兄弟比试，各自放出神奇宝贝，然后智辉的杰尼龟还没打，就先敬个礼，鞠个躬，说声老大好？
那样子，智辉这个做哥的面子在哪里？
果断放弃，以后如果想要的话，再去橘子群岛的水箭龟王国抓一只卡咪龟不更靠谱？
一路上走走停停的，一行人总算是走到了正辉灯塔。
“哥，这就是你目的地啊？正辉博士，是个怎么样的博士啊？很厉害吗？”小智道。
“厉害当然厉害，能当的上博士这两个字的，就没有差的，至于这个人怎么样吗？你见了面就知道了。”智辉想起正辉的特殊爱好，表情古怪道。
走到灯塔前面，智辉朝站在门口和里面的正辉通信，大门自动打开，一群人走入其中，第一次来的小智三人组好奇地东看看西看看，紧接着高台上忽然一道光芒爆发，一个一人高的化石盔坐在上面。
“这是什么神奇宝贝啊？”小智一脸惊讶道。
“这是化石神奇宝贝化石盔吧，相传不是已经灭绝了吗？”小刚也惊讶道。
“以后你们多走走就会发现化石盔这玩意，其实压根儿没灭绝，另外这货也不是化石盔。”智辉表情古怪地看着“化石盔”道，“正辉，你这cosplay的爱好还没有玩腻啊。”
“什么cosplay，我这是用神奇宝贝的方式生活，然
…。。