退往南方，成为世袭的阮主。随后郑氏家族就世袭执掌后黎朝朝政。
在1592年夺取升龙、诛杀莫英祖莫茂洽的战事之后，郑氏权力更加膨胀，并拥有凌驾于后黎朝皇帝的地位。
1677年，郑柞攻灭高平莫氏政权之后，创立了"入朝不拜、书奏不具名"之例，并于黎帝的御座左侧设立郑主的坐椅，后黎朝皇帝完全成为了一个摆设。
郑氏掌权之时，皇室称为"朝廷"，郑主的幕府称为"府僚"。所有事务，不论是政治还是军事事务，皆由府僚管理。后黎朝的朝廷仅仅具有虚名，没有任何实际权力。
这与朝鲜半岛历史上的武人政权、日本历史上的幕府很相似。许多郑主甚至可以根据自己的意愿随意废黜、拥立皇帝，并且诛杀反对自己的后黎朝宗室。