办公大楼和四座兵营，还有两个仓库。在围墙的四个尖角上有四个方形棱堡护卫围墙。
岛上还有3个附属的防御建筑，分别是圣路易堡，主要拱卫和平岛与台湾本岛之间的水道，就是今日基隆的八尺门。圣米兰堡，则是建于和平岛上东侧面向海的山上，负责瞭望。圣安东堡则是盖在和平岛中央山上的制高点。这3座都是圆堡，为岗哨性质的小型防御建筑，主要防御火力都集中在主堡圣萨尔瓦多上。
哨船回来后立刻向上面做了报告。圣萨尔瓦多城的最高长官瓦德斯接到哨船的报告十分惊讶！他立刻问道：“你确定来的是尼德兰人吗？”
船长一听说道：“不，我不确定是不是尼德兰人。但是远远的从船体外形和风帆上来看，是和我们一样的武装商船。要知道，这里的东方船只和我们有很大的差别，一眼就看得出。”
瓦德斯说道：“也就是说，你并没有确认他们的旗帜，对吗？”
船长说道：“问题就在这里。我看到了他们桅杆上面的旗帜。他们似乎是海盗船！”
瓦德斯睁大了眼睛说道：“你喝醉了吗，先生？海盗船怎么会出现在这里？”
船长耸耸肩膀说道：“我也以为我喝醉了！但是我看到了一个黑色的旗子，上面描绘着骷髅和骨头。除了海盗没人会用这样的旗帜！”
其实当时海盗们的旗帜是非常混杂的。黑底骷髅旗只是其中一种而已。只不过是因为后期电影中多使用这种黑底骷髅旗，这才被大家广为人知。
其实在各个时代和各个国家，船只都在桅杆上挂各种不同的、标明它们的国别或其他属性的标志--小旗、三角旗、大旗、军旗。海盗在这方面也不例外。他们在各个时代里都在自己的船桅上升旗。但是海盗们天幸散漫，所以各种各样的旗子都有，并没有规定得很严格的样式。