和陕西、湖广、江西等地不同，四川至今并没有强力的总督或督师专门负责节制诸部兵马，孙传庭即便职责上挂着兼制四川之名，但他根基在陕西，陕西尚未整备完全，短时间对四川也无暇顾及。而当前四川巡抚陈士奇虽好兵书韬略，但在四川任上许久，别无建树，仅因循守旧罢了。川中文武看出他言过其实，并不畏服他，尤其是分散各地的各镇各营兵马势力，更是占地为霸、各行其是，甚至相互之间攻击仇杀，几为常态。
四川一盘散沙，对张献忠而言是好机会，对赵营而言，同样机不可失。
张献忠在武昌府接连受挫之后，果断奔走江西。他手段过人，软硬兼施，很快收并了江西各地众多山匪水寇，众复至五千余。
六月中旬，奔袭建昌府却被益王朱慈炲提前逃走的张献忠率军转进吉安府，兵临府城之下。其时江西按察使兼分巡湖西道岳虞峦正在城中会晤各地官员，讨论清剿张献忠的事宜，未曾料到张献忠会忽然到来。张献忠仅以义子张化龙一人手持铁钩，钩树攀登，一跃而上城头，继而大呼杀人。仅杀一人，守城官军皆惊溃，张化龙随即下城，又杀了一个守城官兵，官兵遂狂奔而走。张献忠则率主力疾驰城下，张化龙从容开门迎入，吉安府城瞬间易手。岳虞峦等官员闻讯，从偏门逃亡。
夺取了吉安府的张献忠随后再攻建昌府，弹指而下，接着席卷南丰、广昌等县，无往不利。待攻克抚州后，兵力扩大到万人，兵锋一度直抵广东的连州、韶州等地。但六月底，袁继咸、吕大器纠集官兵，开始着手反击，接连收复多处州县，张献忠与军师王秉贞、薛正贤商量后决定及早收手，掉转枪头，重新西进。七月初，再抵与湖广交界的袁州，大会群贼，自称“大西王”。
张献忠虽此前在河南、湖广伤筋动骨，但来回南直隶、江西等地这几年，以战养战，元气渐渐恢复，野心再起，便重新厘定全军军制。
因“东席先生”潘独鳌、“西席先生”徐以显皆没，遂改原先的“四先生”为“前后军师”，王秉贞为前军师，薛正贤为后军师。又分军三营，由马步军总管王尚礼、马元利总制。其一为精骑营，为老本嫡系，马军为主，营将王自奇、张化龙、张文秀、张能奇四人；其二为水军营，兵员多为大江沿岸招纳的水贼，通水战，营将王复臣、王自羽、窦名望、高文贵四人；其三为步军营，也是新近归附的各地土寇，协战其他两营，营将白文选、冯双礼、祁三升、贺九仪四人。另有杨武、狄三品、关有才等等将佐各有任职。
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