军官联名上书请求说明开拔地点和作战任务，段向他们作了一次简短训话，鼓励他们奋勇作战，如果这一战不能打胜，不但他个人失败，边防军也一定不能存在，全体官兵的命运均将不堪设想。
同一天，西北军五个旅长都有电报挽留徐树铮仍供原职，久病不起的段系大将倪嗣冲，也到了北京。只是他的病势沉重，一抵京即赴北戴河养病去了。
北京城顿时成了谣言城、恐惧城，达官贵人纷纷出京避难。东交民巷的使馆区和外国饭店都告客满，张作霖也搬到奉天会馆加强戒备。
七月六日，徐世昌又请张作霖去团河再作最后一次努力。
这天段的火气特别大，咆哮着说：“罢免吴佩孚，万事皆休！”
张说：“这恐怕办不到吧！”
张作霖劝段冷静，应该化大事为小事，退一步着想。
段听了很不耐烦地说：“你回你的奉天，不必管这儿闲事。”
张听了一声不响就告辞而去。
接下来，段派积极备战，直军亦布置防线。
七日深夜一时，张作霖并未与任何人作别，悄然乘车出京，在军粮城下车，随即声言“局外中立”！
八日午前，段祺瑞由团河回到北京城，在将军府召集全体阁员及军政首要举行联席特别会议，靳云鹏等均列席，出席人员逾八百余人。
在发了疯的段祺瑞主导下，会议决定呈请总统将曹锟、吴佩孚、曹锳免职，交给段亲自查办。
下午国务院开临时会议，吴佩孚予以免职处分，曹锟则改为褫职留任，由交通总长曾毓隽、司法总长朱深送府盖印。
段在将军府议决惩办曹吴后，明知曹吴一定反抗，必至兵戎相见。回到私宅后，召集近畿各师长，研究出兵计划。
决定派出五师，以曲同丰所部边防军第一师为第一线，刘询所部第十五师为第二线，陈文运边防军第三师为第三线，李进才第十三师为第四线，魏宗翰第九师为第五线。
同时命交通部转饬京汉路局赶备专车输送。这一来，“惊惶的北京城，更为恐慌，纸币骤跌，要人家眷纷纷迁徙，箱笼什物遍街触目”。情形一如张勋复辟前后。
段祺瑞呈徐世昌请拿办曹吴呈文云：
“呈为揭劾奸凶，呈明拿办，以整纲纪而振人心事。窃维国于天地，必有与立。法制纪纲，人人所应恪守。封疆大吏，膺方面之重寄，为群众所具瞻，宜如何正己率属，恪供尔职，双报国家倚畀之隆，而尽守法
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