“鸣人，好险，下次不要再这样冲动了！”
“就是，如果不是大和老师，你就又闯祸了！你这冲动的臭毛病真是一如既往呢！”
“抱歉，抱歉，嘻嘻，大和老师，小樱，我真的就差那么一丁点，就抓住那个家伙了！”
在一片荒芜的沙漠之中，一个带着兜状护额的忍者，带着三个还是少年的忍者，正望着沙漠地坑中巨大的废墟，一阵后怕。
他们正是由五代目火影纲手派出执行任务的第七班。
由于佐助叛村，前往大蛇丸基地进修，目前第七班的成员是漩涡鸣人、春野樱，以及接替佐助的佐井。
同时由于目前鸣人无法控制体内九尾的力量，九尾时常趁乱暴走，第七班的带班老师也由精通三室两厅之术，能够以木遁克制九尾的大和队长来接替。
而原来的带队老师，旗木卡卡西则在木叶医院的病床上养生。
大和不但是卡卡西的晚辈，同时也是他小迷弟，个人能力也非常出色，体内还移植的柱间细胞，明面上唯一能够使用木遁的人。
今天这个新第七班的任务目标是抓捕一个名为百足的砂隐村叛忍。
这个这个叛忍阴险狡诈，精通机关傀儡之术，是十分危险的敌人。
就在刚才，经过一系列战斗后，穷途末路的百足妄想打开二十多年前四代火影波风水门的封印，以控制传说中的楼兰龙脉。
但龙脉被四代封印，岂是能轻易打开的！
百足为了将封印打开，打算不顾一切拔出了水门封印阵法阵眼的苦无，将封印引入自己身上，试图解开封印。
按照原本的剧情，百足拔出苦无后，水门留下的所有术式全部引导到他身上，整个封印祭坛也随之碎裂，涌现出巨大的能量光束。
而性子急躁的漩涡鸣人为了抓住百足，也失足跌落祭坛。
同时，大和队长为了救他，使用了木遁·大树林之术，也被一同卷入。
春野樱想要跳下去找鸣人，却被佐井阻拦，以画中鸟带出升天，并没有进入龙脉之中。
鸣人和大和队长将在龙脉另一侧，进行一段奇妙的旅行，与年轻的水门、丁座、志微、卡卡西结识，并且父子并肩战斗，双剑合璧用出大招太极螺旋丸，击败敌人，
不过最终，水门以“为了不引起历史的紊乱，必须消除大家的记忆，再各自回到原来的世界”这样无聊的理由，抹除了大家的记忆。
小樱和佐井在祭坛便找到
…。。