在白石晒着太阳，安逸补觉的时候，隔壁车厢里，画风却截然不同。
关系好的女生凑在一起，话总是比较多，毛利兰和铃木园子聊着聊着，就扯到了柯南的事。
和已经习惯了柯南存在的毛利兰不同，铃木园子很好奇柯南的父母为什么不管他——这孩子看起来也不像有什么先天缺陷，而且他一直很安静，乍一看没有寻常小孩那么熊。
柯南当然不想解释这麻烦的问题，于是在毛利兰也带着疑问看过来时，他跳下座位，丢下一句“我去洗手间！”，就快速溜走了。
在前往厕所的路上，柯南迎面遇到了两个刚上车的人。
那两人都穿着一身黑色，其中一人有着一头极其显眼的银白色长发，另一人则有一个与众不同的地包天下巴。
这让柯南瞬间认出了他们是谁，没用一秒，他的冷汗就把后背染湿了。
事发突然，柯南脑中一片空白，他僵在了路中间。
等意识到两名黑衣人因为他挡住了路，都在低下头看他时，柯南瞳孔骤缩，心道完了。
然而出乎他意料的是，两人并没有露出惊讶或狰狞的表情，似乎完全不认识他。
只有那个地包天不耐烦的朝他挥了挥手，让他别呆在那挡路。
柯南同手同脚的退到路边，抬头看着两人目不斜视的走过，他慢慢意识到，黑衣人们似乎没认有出他来。
——在他还是“工藤新一”，那个名声响亮的高中生侦探时，他曾经在游乐园看到过这两个打扮奇特，行踪鬼祟的人。
一时好奇跟上去后，他发现其中的黑衣地包天，正在勒索某个老板模样的人。
工藤新一那时还是个正义小斗士，看到这场景，他二话不说掏出相机，开始偷拍交易现场。
没成想偷拍到一半，另一名黑衣银长直突然自他背后闪现，一闷棍把他撂倒，然后那俩人为了毁尸灭迹，给他灌了一种能让人融化的新毒药。
那一晚，工藤新一消失了。世界上多出了一个名叫“柯南”的小孩。
回想到这，柯南也渐渐明白了——变成小孩，只是一场幸运的意外。
而实际上，在这两个凶手眼里，“工藤新一”已经彻底是个死人。
也就是说，他暂时不会因为被两人看到而暴露身份。
既然这样，这或许是一次难得的机会……
柯南始终坚信，只要拿到那种毒药，博士就能研究出对应的解药，从而让他恢复成
…。。