凤阳巡抚于大明正统十四年，由山东淮阳巡抚分离，辖区包括凤阳府、淮安府、扬州府、庐州府及滁州、徐州、和州。
淮左豪杰凤阳人朱元璋推翻元王朝后，在应天府称帝并建立了大明王朝，起初朱元璋是想将国都定在凤阳老家的，并提出了一堆理由：应天府距离中原太过遥远，不易威慑北方。（这一点在朱元璋死后的燕王谋反中得到证实）而凤阳这个地方，正好就处在大明王朝的正中心，且凤阳还有长江、淮河作为天险防卫，运输粮食也很方便。
皇帝难得提出这么多理由游说，而且还是一向乾纲独断的朱元璋，大家也不好说什么，但刘伯温却嫌弃凤阳的风水不好，当然那些大臣也不想搬出奢华的南京城去较为偏远的凤阳重建朝廷，在众望之下刘伯温向朱元璋上书称：“凤阳虽帝乡，非建都地。”
刘伯温一说群臣附应。迁都的主意虽打消了，但刘伯温得给朱元璋一个台阶下，便和群臣商议，最终得出了一个两全之策：将江淮与江宁、苏州合二为一组建一个全国最大的行省——南直隶省（后世的江南省）。此举既可以让凤阳拥有首府地位也可以保全南京的帝都身份，洪武十一年，随着南直隶行省的规划，南京这才正式成为首都。
自两晋就开始的经济中心南迁在南方，这也在大明初期就已经完善，江浙一带自宋末开始就已经有了“苏湖熟，天下足”的美称。在本朝初，南方鄱阳湖水战后就已经没了战乱，再加之南方水稻每年至少两熟，经济恢复的非常迅捷。而北方则要等到永乐皇帝带着大量南方移民迁都北京之后，才逐步稳定。
也就是说在元末至大明前中期的一段时间里整个北方连一个相对稳定的社会结构都没有，再加上元末的黄河水涝并没能完全治理成功，经济和产粮自然差之又差。
永乐年间，永乐大帝朱棣为了远征北元而大量向民间征调人力、物力，其中最重要的一项就是向各地商人开放贩私盐的资格。不过这需要这些商人将自己的粮食、棉花、煤炭等战略物资送到北方前线来换取盐引，这便是开中法。
这一措施本是为了扶持北方的经济，也确实诞生了晋商这一支昌盛大明数十代的商帮，但位处南方的徽商也看到了商机，他们比起晋商更有大运河之便利、南直隶省做后台，在这数百年间，迅速崛起，并将南直隶省的经济带上一个新的巅峰。
扬州、南京的盐商文化就是在此时发展出来的，据说：南直隶省的税收占全国的三分之一、朝廷官员一半都是出自南直隶省且随着每期科举逐
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