清政府数千次发布“屠城令”，并带领大军参与血洗江南、岭南、西北等地区，甚至勾结荷兰殖民者，攻屠思明州厦门。当时清军曾将四川人杀绝，后来不得不“湖广填四川”来进行大移民。 清朝不仅屠杀汉人，对其他民族也实施大屠杀，西北的回族和西南的苗族也被清军屠杀过。
虽然经过了清朝文字狱的摧残，屠杀一事不见于许多历史文献。 但这些大规模屠杀依然留下了大量的真实记录，广州大屠杀有西方传教士目击纪录，朝鲜亦记载了东北屠杀与华北屠杀记录，至于大同之屠甚至在第一历史档案馆都可以找到资料。
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