就在定国在缅甸整军备战之际，永历十五年正月初七日，清顺治帝于养心殿病逝，时年二十四岁，庙号世祖。其第三子爱新觉罗玄烨以八岁的幼龄登上了皇位，并改次年为康熙元年。
消息传至云南，吴三桂顿时陷入了彷徨之中，按理说他身为亲王，为尽人臣之礼，理应进京哭拜先帝，可吴三桂担心如今云南形势渐渐稳定，而自己手握重兵，若是回去，朝廷会借机把他扣留在北京。为了防备朝廷的意外之举，吴三桂思虑再三，最终决定以退为进，将所部藩兵分为数股，陆续启行。
一时间，在云南通往北京的官道之上，人马塞途，居民走匿，吴三桂方才刚行至半途，其先头部队便已然抵近至京郊。吴三桂的异常举动也引起了清廷的高度警觉，为防止出现意外情况，四大辅政大臣在经过紧急商议之后，决定以康熙帝的名义颁下谕旨，命吴三桂不必进京，只须在京城外搭厂设祭即可。
吴三桂见目的达到，于是故作姿态地据理力争了一番，这才遵诏而行，传令全军停止前进，然后在京郊新设的顺治帝灵前假惺惺地哭拜了一场，旋即迅速提兵返回云南去了。
此时，在明军的步步紧逼下，缅甸朝堂之上已然乱成了一锅粥，诸臣皆众口一词，要求缅王莽达喇尽快将永历帝这个祸害送走。莽达喇思忖着就这么把永历帝送还给明军实在是心有不甘，遂干脆派出使者前往昆明，请求吴三桂出兵帮助剿灭驻扎滇缅边境的明朝军队，并承诺只要吴三桂肯出兵援缅，自己愿意送出永历帝作为见面礼。
吴三桂大喜过望，然而他认为现在机会虽然不错，但时序已过，不利于大军出征，倒不如虚张声势，摆出出兵的架势，借以牵制缅方不要把永历帝交还给明军。
为此，他立即上疏清廷，疏中言道：“春深非用兵之时，宜许以应援，遣永昌、大理边防兵，裹粮出边作声势，巡行蛮疆，促缅人备船，称大兵即至，应之以术，然后可则缅人送永历也。”
在送走缅王派来的使者后，为了给将来的军事行动扫除后顾之忧，吴三桂又亲率大军进攻先前响应明军起兵抗清的磨乃土司龙吉兆、龙吉佐兄弟，因先前与那嵩曾有盟约，兄弟二人自是誓死不降，苦苦坚守了七十余日，终因粮尽援绝，城陷被擒。
吴三桂亲自审问二人，不解地问道：“朝廷素来待汝等不薄，为何听信李定国之言，图谋造反？”
龙吉兆凛然一笑道：“吾等受国恩三百年，仗义守死，如何称之为谋反？倒是王爷你，世受国恩，却死心塌地为
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