间南门桥下河水皆被血水染红，积尸阻流，直到十几天后，方才飘荡而尽。经此一番，被杀诸生多达两万两千三百余人，惟有两名高不及绳的年幼士子得以幸免于难。
在杀光诸生之后，张献忠认为识文断字的医师也是危险分子，于是下令将全城医师尽数聚集至皇宫之中，又让太监搬出原先蜀王府中的一具医用铜人，将铜人身上穴位全部用纸盖住，让众医师上前扎穴，但凡有一个穴位扎错，即刻处死。
在如此杀气腾腾的场面下，又有几个人能够气定神闲的认准穴位，一场考试下来，城内医师便被杀掉了一大半。
紧接着，张献忠又下旨将成都附近的和尚、道士、工匠艺人全都抓了起来，准备将他们斩尽杀绝。
定国和文秀闻讯急忙赶进宫中面见张献忠，见到张献忠，定国和文秀二话不说，扑通一声跪倒在地，砰砰地连磕了几个响头，待他们再抬起头，额头上早已是鲜血淋漓了。
“你们这是做什么？赶紧给老子起来！”张献忠望着两名义子，满脸的惊愕。
“儿臣请求父皇停止杀戮，放过那些无辜百姓吧！”定国和文秀几乎异口同声地劝谏道。
张献忠大怒道：“鸟！什么时候轮到你们这些小子来教老子？再不起来，休怪老子不客气！”
不想等了许久，二人依旧跪在地上没有起来，腰杆却挺得笔直，空气中充满了紧张的气氛。见此情形，张献忠忽然冷笑一声道：“好啊！你们两个翅膀硬了是吧！就连老子的话都不听了！来人，给老子将这两个不肖子打入大狱，听候发落！”
立刻就有御林军从殿外一拥而入，将定国和文秀二人按住，径直押往大狱。
正当张献忠大开杀戒之时，成都的孔庙忽然骤起大火。张献忠得报心中忐忑，连忙询问汪兆龄道：“汪丞相，这火起得蹊跷，莫非是孔夫子不愿让老子杀这班读书人？”
汪兆龄赶忙献媚道：“陛下勿扰，此乃孔夫子告诉咱们，四川的文运走到了尽头！”
张献忠听罢顿时放心下来，遂下令各州县将那些被杀戮的诸生家眷全部押解入京，然后将这些人赶至城郊早已挖好的万人坑前，尽数推入坑中，活埋而死。
至此，全川读书人皆被张献忠屠戮干净，惟有雅州的士子得以幸免。原来当时雅州士子接到张献忠特科取士的圣谕后不敢怠慢，连忙纷纷启程奔赴成都。
然而上南道御史郝孟旋听闻此事，断定这是一个骗局，在良心的驱使下，他火速伪造了一份诏书，派人
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