在修行的同时也指导涡忍们训练。小毅借用了木叶的制度，开设了忍者学校。现在第三批学生已经正式入学了，用不了几年就可以为忍村输送忍者了。现在漩涡隐村的忍者数量不多，所以只能在质量上下功夫了。
小毅根据涡忍们的天赋，分别让他们定向学习忍术、封印术、感知术和医疗忍术。小毅将忍者小队的成员变成了五人，标配两个忍术忍者、一个封印术忍者、一个感知型忍者和一个医疗忍者。当然有些忍者可以既擅长封印术又擅长感知忍术，那么就可以增加一个忍术忍者。反正每个小队必须配齐三种特殊型的忍者。
过了几天，小毅忽然感觉到体内九尾的异动。小毅感觉到在火之国出现了另外一股九尾查克拉。查克拉也源头并不是鸣人，而是其他的存在。
第二天小毅就收到了来着木叶的情报。木叶又被一群忍者进攻了。小毅也挺无语的，明明是能够独战四大忍村的木叶，却总是受到一些忍者的破坏，而且每次伤亡都不小。
这一次木叶也闹得很厉害，甚至出现了两只九尾的战斗。其中一个自然是鸣人，而另一个却不是小毅。对方只是一个拥有九尾查克拉的赝品罢了。
又过了几天，小毅就得到了地陆死亡的消息。说实话，小毅对地陆的人头也很感兴趣，那可是价值3000万两啊。
不过地陆死掉的话，阿斯玛和不死二人组的战斗也快了吧。
“赖人，修行得怎么样了？有时间的话跟我出去一趟。”
“随时可以！”
赖人非常高兴能和小毅一起出去，每次出门都有架可以打呢。
“毅大哥，我们这次去哪里？”
小毅：“火之寺。”
“是寺庙啊，去寺庙干嘛？”
“打架！”
赖人兴奋起来：“好诶，最近我学了几个很棒的冰遁忍术呢，正好可以实验一下。”
“毅大哥等等我啊！”
小毅没有带赖人一起，直接用飞雷神到了木叶。
小毅进入木叶后，用神乐心眼找到了鸣人的位置。此时上百个鸣人正站在瀑布前，打算用风遁查克拉切断瀑布。鸣人之前并没有学习过查克拉的性质变化，现在想要学习螺旋手里剑要付出更多的努力呢。
小毅也不知道这两年鸣人到底跟着自来也学习了什么，比之前也就多一个大玉螺旋丸。自来也自然是一个很好的老师，但这两年的成果却一般。
鸣人用影分身练习忍术会减少很多的时间
…。。